离子色谱仪主要用于环境样品的分析，包括地面水、饮用水、雨水、生活污水、工业废水、酸沉降物、大气颗粒物等样品中的阴、阳离子，还可用于与微电子工业有关的水和试剂中痕量杂质的分析。离子色谱法利用混合物中组分离子在流动相和固定相间分配系数的差别，当离子在两相间做相对移动时，各离子在两相间进行多次分配从而使各组分离子得到分离，其过程的本质是待分离混合离子在固定相和流动相之间分配平衡的过程。然后用电导或紫外检测器对分离出来的离子进行定性检测，再结合色谱进行定量分析。离子色谱仪的技术方法将分析过程分为萃取、测试和计算三个步骤。